La ciudad fue representada en la Segunda División de la Liga chilena de fútbol por Independiente de Cauquenes, tras la aprobación de la Asociación Central de Fútbol en 1971. El equipo jugó de local en el Estadio Municipal de Cauquenes y fue el año 1979 cuando logró su mayor rendimiento, cayendo en la última recta ante Audax Italiano. En 1990 el club optó por desaparecer por motivos financieros.
En la actualidad, se busca revivir la presencia deportiva de Cauquenes con la incursión de independiente de Cauquenes en la Segunda División del Fútbol Chileno (Anfp) y de Caupolicán en la Tercera B (Anfa).
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